Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
BHMTQ93088 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHMTQ93088 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms