Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA4DQ92854 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA4DQ92854 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms