Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATRIPQ8WXE1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms