Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD9

CASKIN1, Caskin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN1Q8WXD9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC33.82■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC33.81■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC33.8■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.8■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC33.8■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC33.79■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC33.78■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC33.77■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC33.77■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CASKIN1Q8WXD9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CASKIN1Q8WXD9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CASKIN1Q8WXD9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CASKIN1Q8WXD9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CASKIN1Q8WXD9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CASKIN1Q8WXD9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CASKIN1Q8WXD9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CASKIN1Q8WXD9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CASKIN1Q8WXD9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CASKIN1Q8WXD9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CASKIN1Q8WXD9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CASKIN1Q8WXD9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CASKIN1Q8WXD9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CASKIN1Q8WXD9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CASKIN1Q8WXD9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CASKIN1Q8WXD9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CASKIN1Q8WXD9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CASKIN1Q8WXD9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CASKIN1Q8WXD9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CASKIN1Q8WXD9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CASKIN1Q8WXD9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CASKIN1Q8WXD9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CASKIN1Q8WXD9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
CASKIN1Q8WXD9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CASKIN1Q8WXD9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CASKIN1Q8WXD9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CASKIN1Q8WXD9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
CASKIN1Q8WXD9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CASKIN1Q8WXD9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CASKIN1Q8WXD9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CASKIN1Q8WXD9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CASKIN1Q8WXD9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CASKIN1Q8WXD9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms