Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX93

PALLD, Palladin, humanhuman

Predictions only

Length 1,383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALLDQ8WX93 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PALLDQ8WX93 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PALLDQ8WX93 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PALLDQ8WX93 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PALLDQ8WX93 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PALLDQ8WX93 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PALLDQ8WX93 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PALLDQ8WX93 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PALLDQ8WX93 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PALLDQ8WX93 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PALLDQ8WX93 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PALLDQ8WX93 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PALLDQ8WX93 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PALLDQ8WX93 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PALLDQ8WX93 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PALLDQ8WX93 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PALLDQ8WX93 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PALLDQ8WX93 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PALLDQ8WX93 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PALLDQ8WX93 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PALLDQ8WX93 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PALLDQ8WX93 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PALLDQ8WX93 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PALLDQ8WX93 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PALLDQ8WX93 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PALLDQ8WX93 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PALLDQ8WX93 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PALLDQ8WX93 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PALLDQ8WX93 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PALLDQ8WX93 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PALLDQ8WX93 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PALLDQ8WX93 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PALLDQ8WX93 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PALLDQ8WX93 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PALLDQ8WX93 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PALLDQ8WX93 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PALLDQ8WX93 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PALLDQ8WX93 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PALLDQ8WX93 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PALLDQ8WX93 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PALLDQ8WX93 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PALLDQ8WX93 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PALLDQ8WX93 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PALLDQ8WX93 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PALLDQ8WX93 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PALLDQ8WX93 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PALLDQ8WX93 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PALLDQ8WX93 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PALLDQ8WX93 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PALLDQ8WX93 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PALLDQ8WX93 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PALLDQ8WX93 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PALLDQ8WX93 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms