Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf54Q8WWF1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf54Q8WWF1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf54Q8WWF1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf54Q8WWF1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf54Q8WWF1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf54Q8WWF1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf54Q8WWF1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf54Q8WWF1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf54Q8WWF1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf54Q8WWF1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf54Q8WWF1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf54Q8WWF1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf54Q8WWF1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf54Q8WWF1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf54Q8WWF1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf54Q8WWF1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf54Q8WWF1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf54Q8WWF1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf54Q8WWF1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf54Q8WWF1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf54Q8WWF1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf54Q8WWF1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf54Q8WWF1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf54Q8WWF1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf54Q8WWF1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf54Q8WWF1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf54Q8WWF1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf54Q8WWF1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf54Q8WWF1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf54Q8WWF1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf54Q8WWF1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf54Q8WWF1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf54Q8WWF1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf54Q8WWF1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf54Q8WWF1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf54Q8WWF1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf54Q8WWF1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf54Q8WWF1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf54Q8WWF1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf54Q8WWF1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf54Q8WWF1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf54Q8WWF1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf54Q8WWF1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf54Q8WWF1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
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