Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR0

TRAF3IP1, TRAF3-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1Q8TDR0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAF3IP1Q8TDR0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF3IP1Q8TDR0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms