Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLHDC4Q8TBB5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLHDC4Q8TBB5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLHDC4Q8TBB5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLHDC4Q8TBB5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLHDC4Q8TBB5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KLHDC4Q8TBB5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KLHDC4Q8TBB5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KLHDC4Q8TBB5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KLHDC4Q8TBB5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KLHDC4Q8TBB5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KLHDC4Q8TBB5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KLHDC4Q8TBB5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KLHDC4Q8TBB5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KLHDC4Q8TBB5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KLHDC4Q8TBB5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KLHDC4Q8TBB5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KLHDC4Q8TBB5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KLHDC4Q8TBB5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KLHDC4Q8TBB5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KLHDC4Q8TBB5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KLHDC4Q8TBB5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
KLHDC4Q8TBB5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KLHDC4Q8TBB5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KLHDC4Q8TBB5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KLHDC4Q8TBB5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KLHDC4Q8TBB5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KLHDC4Q8TBB5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KLHDC4Q8TBB5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KLHDC4Q8TBB5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KLHDC4Q8TBB5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KLHDC4Q8TBB5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KLHDC4Q8TBB5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KLHDC4Q8TBB5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KLHDC4Q8TBB5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KLHDC4Q8TBB5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KLHDC4Q8TBB5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KLHDC4Q8TBB5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KLHDC4Q8TBB5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KLHDC4Q8TBB5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KLHDC4Q8TBB5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KLHDC4Q8TBB5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KLHDC4Q8TBB5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KLHDC4Q8TBB5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms