Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms