Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBOF1Q8ND07 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms