Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCX0

CCDC150, Coiled-coil domain-containing protein 150, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC150Q8NCX0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC150Q8NCX0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC150Q8NCX0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC150Q8NCX0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC150Q8NCX0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC150Q8NCX0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC150Q8NCX0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC150Q8NCX0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC150Q8NCX0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC150Q8NCX0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC150Q8NCX0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC150Q8NCX0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC150Q8NCX0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC150Q8NCX0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC150Q8NCX0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC150Q8NCX0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC150Q8NCX0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC150Q8NCX0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC150Q8NCX0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC150Q8NCX0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC150Q8NCX0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC150Q8NCX0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC150Q8NCX0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC150Q8NCX0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms