Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARRDC4Q8NCT1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARRDC4Q8NCT1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms