Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RDH13Q8NBN7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RDH13Q8NBN7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RDH13Q8NBN7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RDH13Q8NBN7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RDH13Q8NBN7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms