Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms