Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7H5

PAF1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAF1Q8N7H5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAF1Q8N7H5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms