Protein–RNA interactions for Protein: Q8N144

GJD3, Gap junction delta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD3Q8N144 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms