Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms