Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms