Protein–RNA interactions for Protein: Q86U38

NOP9, Nucleolar protein 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP9Q86U38 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOP9Q86U38 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOP9Q86U38 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOP9Q86U38 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NOP9Q86U38 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOP9Q86U38 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOP9Q86U38 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NOP9Q86U38 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOP9Q86U38 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOP9Q86U38 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOP9Q86U38 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOP9Q86U38 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOP9Q86U38 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOP9Q86U38 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOP9Q86U38 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOP9Q86U38 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOP9Q86U38 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOP9Q86U38 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOP9Q86U38 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOP9Q86U38 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOP9Q86U38 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOP9Q86U38 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOP9Q86U38 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOP9Q86U38 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOP9Q86U38 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOP9Q86U38 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOP9Q86U38 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOP9Q86U38 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms