Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RBBP6Q7Z6E9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms