Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z460

CLASP1, CLIP-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLASP1Q7Z460 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CLASP1Q7Z460 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms