Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT27Q7Z3Y8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT27Q7Z3Y8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms