Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
UBE3BQ7Z3V4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms