Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APTXQ7Z2E3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms