Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
RUFY3Q7L099 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUFY3Q7L099 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms