Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
HECW1Q76N89 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
HECW1Q76N89 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC33.81■■■■□ 3
HECW1Q76N89 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
HECW1Q76N89 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
HECW1Q76N89 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
HECW1Q76N89 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
HECW1Q76N89 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
HECW1Q76N89 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
HECW1Q76N89 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
HECW1Q76N89 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
HECW1Q76N89 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
HECW1Q76N89 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
HECW1Q76N89 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
HECW1Q76N89 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
HECW1Q76N89 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC33.79■■■■□ 3
HECW1Q76N89 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
HECW1Q76N89 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
HECW1Q76N89 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
HECW1Q76N89 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
HECW1Q76N89 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
HECW1Q76N89 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
HECW1Q76N89 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
HECW1Q76N89 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
HECW1Q76N89 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
HECW1Q76N89 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC33.78■■■■□ 3
HECW1Q76N89 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC33.78■■■■□ 3
HECW1Q76N89 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC33.78■■■■□ 3
HECW1Q76N89 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC33.78■■■■□ 3
HECW1Q76N89 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
HECW1Q76N89 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
HECW1Q76N89 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
HECW1Q76N89 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC33.77■■■■□ 3
HECW1Q76N89 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
HECW1Q76N89 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
HECW1Q76N89 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
HECW1Q76N89 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
HECW1Q76N89 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
HECW1Q76N89 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
HECW1Q76N89 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
HECW1Q76N89 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
HECW1Q76N89 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
HECW1Q76N89 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
HECW1Q76N89 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
HECW1Q76N89 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
HECW1Q76N89 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
HECW1Q76N89 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
HECW1Q76N89 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
HECW1Q76N89 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
HECW1Q76N89 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
HECW1Q76N89 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
HECW1Q76N89 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
HECW1Q76N89 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
HECW1Q76N89 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
HECW1Q76N89 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
HECW1Q76N89 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
HECW1Q76N89 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
HECW1Q76N89 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
HECW1Q76N89 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
HECW1Q76N89 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
HECW1Q76N89 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
HECW1Q76N89 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
HECW1Q76N89 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
HECW1Q76N89 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
HECW1Q76N89 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
HECW1Q76N89 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
HECW1Q76N89 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
HECW1Q76N89 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
HECW1Q76N89 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
HECW1Q76N89 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
HECW1Q76N89 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
HECW1Q76N89 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
HECW1Q76N89 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
HECW1Q76N89 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
HECW1Q76N89 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
HECW1Q76N89 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
HECW1Q76N89 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
HECW1Q76N89 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
HECW1Q76N89 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
HECW1Q76N89 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
HECW1Q76N89 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC33.71■■■□□ 2.99
HECW1Q76N89 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
HECW1Q76N89 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
HECW1Q76N89 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
HECW1Q76N89 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
HECW1Q76N89 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
HECW1Q76N89 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
HECW1Q76N89 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
HECW1Q76N89 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
HECW1Q76N89 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
HECW1Q76N89 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
HECW1Q76N89 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
HECW1Q76N89 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
HECW1Q76N89 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
HECW1Q76N89 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
HECW1Q76N89 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
HECW1Q76N89 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
HECW1Q76N89 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
HECW1Q76N89 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
HECW1Q76N89 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms