Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP31Q70CQ4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP31Q70CQ4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP31Q70CQ4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP31Q70CQ4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP31Q70CQ4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP31Q70CQ4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP31Q70CQ4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP31Q70CQ4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP31Q70CQ4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP31Q70CQ4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
USP31Q70CQ4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
USP31Q70CQ4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP31Q70CQ4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP31Q70CQ4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP31Q70CQ4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP31Q70CQ4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP31Q70CQ4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP31Q70CQ4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP31Q70CQ4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP31Q70CQ4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP31Q70CQ4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP31Q70CQ4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP31Q70CQ4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP31Q70CQ4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP31Q70CQ4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP31Q70CQ4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
USP31Q70CQ4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP31Q70CQ4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP31Q70CQ4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP31Q70CQ4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP31Q70CQ4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP31Q70CQ4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP31Q70CQ4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP31Q70CQ4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP31Q70CQ4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP31Q70CQ4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP31Q70CQ4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP31Q70CQ4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP31Q70CQ4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms