Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBS12Q6ZW61 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms