Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms