Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZST2

ZCCHC23, Zinc finger CCHC domain-containing protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC23Q6ZST2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZCCHC23Q6ZST2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms