Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms