Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXD4L3Q6VB84 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms