Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWP7

LCLAT1, Lysocardiolipin acyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCLAT1Q6UWP7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LCLAT1Q6UWP7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms