Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SUSD1Q6UWL2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SUSD1Q6UWL2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SUSD1Q6UWL2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SUSD1Q6UWL2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SUSD1Q6UWL2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SUSD1Q6UWL2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SUSD1Q6UWL2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SUSD1Q6UWL2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SUSD1Q6UWL2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SUSD1Q6UWL2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SUSD1Q6UWL2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SUSD1Q6UWL2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SUSD1Q6UWL2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SUSD1Q6UWL2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SUSD1Q6UWL2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SUSD1Q6UWL2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SUSD1Q6UWL2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SUSD1Q6UWL2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SUSD1Q6UWL2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SUSD1Q6UWL2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SUSD1Q6UWL2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SUSD1Q6UWL2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SUSD1Q6UWL2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms