Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMARCD3Q6STE5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SMARCD3Q6STE5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMARCD3Q6STE5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMARCD3Q6STE5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMARCD3Q6STE5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMARCD3Q6STE5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SMARCD3Q6STE5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMARCD3Q6STE5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SMARCD3Q6STE5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMARCD3Q6STE5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMARCD3Q6STE5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMARCD3Q6STE5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMARCD3Q6STE5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMARCD3Q6STE5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMARCD3Q6STE5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMARCD3Q6STE5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMARCD3Q6STE5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMARCD3Q6STE5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMARCD3Q6STE5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMARCD3Q6STE5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMARCD3Q6STE5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMARCD3Q6STE5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms