Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms