Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC137Q6PK04 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms