Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJF5

RHBDF2, Inactive rhomboid protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF2Q6PJF5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms