Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CAVIN1Q6NZI2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAVIN1Q6NZI2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms