Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HMBOX1Q6NT76 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms