Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms