Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZY7

SCARA3, Scavenger receptor class A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA3Q6AZY7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCARA3Q6AZY7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARA3Q6AZY7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARA3Q6AZY7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARA3Q6AZY7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARA3Q6AZY7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARA3Q6AZY7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARA3Q6AZY7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARA3Q6AZY7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARA3Q6AZY7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARA3Q6AZY7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARA3Q6AZY7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARA3Q6AZY7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARA3Q6AZY7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARA3Q6AZY7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARA3Q6AZY7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARA3Q6AZY7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARA3Q6AZY7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCARA3Q6AZY7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCARA3Q6AZY7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCARA3Q6AZY7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCARA3Q6AZY7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCARA3Q6AZY7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCARA3Q6AZY7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCARA3Q6AZY7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCARA3Q6AZY7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCARA3Q6AZY7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCARA3Q6AZY7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms