Protein–RNA interactions for Protein: Q68D51

DENND2C, DENN domain-containing protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2CQ68D51 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DENND2CQ68D51 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENND2CQ68D51 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms