Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG87

PAPD7, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPD7Q5XG87 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PAPD7Q5XG87 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPD7Q5XG87 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPD7Q5XG87 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPD7Q5XG87 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPD7Q5XG87 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPD7Q5XG87 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPD7Q5XG87 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPD7Q5XG87 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPD7Q5XG87 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPD7Q5XG87 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPD7Q5XG87 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPD7Q5XG87 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPD7Q5XG87 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPD7Q5XG87 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAPD7Q5XG87 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAPD7Q5XG87 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAPD7Q5XG87 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PAPD7Q5XG87 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAPD7Q5XG87 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAPD7Q5XG87 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAPD7Q5XG87 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAPD7Q5XG87 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAPD7Q5XG87 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAPD7Q5XG87 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAPD7Q5XG87 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAPD7Q5XG87 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PAPD7Q5XG87 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PAPD7Q5XG87 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAPD7Q5XG87 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAPD7Q5XG87 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAPD7Q5XG87 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAPD7Q5XG87 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAPD7Q5XG87 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAPD7Q5XG87 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAPD7Q5XG87 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAPD7Q5XG87 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAPD7Q5XG87 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PAPD7Q5XG87 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAPD7Q5XG87 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAPD7Q5XG87 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAPD7Q5XG87 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAPD7Q5XG87 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAPD7Q5XG87 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAPD7Q5XG87 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAPD7Q5XG87 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAPD7Q5XG87 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAPD7Q5XG87 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms