Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CARMIL1Q5VZK9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CARMIL1Q5VZK9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CARMIL1Q5VZK9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CARMIL1Q5VZK9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CARMIL1Q5VZK9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CARMIL1Q5VZK9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CARMIL1Q5VZK9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
CARMIL1Q5VZK9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CARMIL1Q5VZK9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CARMIL1Q5VZK9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CARMIL1Q5VZK9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CARMIL1Q5VZK9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CARMIL1Q5VZK9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CARMIL1Q5VZK9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CARMIL1Q5VZK9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CARMIL1Q5VZK9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CARMIL1Q5VZK9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CARMIL1Q5VZK9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
CARMIL1Q5VZK9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CARMIL1Q5VZK9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
CARMIL1Q5VZK9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC35.26■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
CARMIL1Q5VZK9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CARMIL1Q5VZK9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
CARMIL1Q5VZK9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CARMIL1Q5VZK9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CARMIL1Q5VZK9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CARMIL1Q5VZK9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CARMIL1Q5VZK9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CARMIL1Q5VZK9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CARMIL1Q5VZK9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CARMIL1Q5VZK9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CARMIL1Q5VZK9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CARMIL1Q5VZK9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CARMIL1Q5VZK9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CARMIL1Q5VZK9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CARMIL1Q5VZK9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CARMIL1Q5VZK9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CARMIL1Q5VZK9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CARMIL1Q5VZK9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CARMIL1Q5VZK9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CARMIL1Q5VZK9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CARMIL1Q5VZK9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CARMIL1Q5VZK9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CARMIL1Q5VZK9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
CARMIL1Q5VZK9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CARMIL1Q5VZK9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms