Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms