Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CEP350Q5VT06 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms