Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSR9

SPANXN1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N1, humanhuman

Predictions only

Length 72 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN1Q5VSR9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms