Protein–RNA interactions for Protein: Q5TYX0

PRAMEF5, PRAME family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF5Q5TYX0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms