Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM78Q5T7P6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms